Le créateur de Final Fantasy et dessinateur de Chrono Trigger Hironobu Sakaguchi a révélé son désir de faire que Chrono Trigger évoluait un peu pareil que Final Fantasy, en manière d'une série. Le fondateur de Mistwalker a mentionné cela durant le PAX Prime.

Sakaguchi a travaillé comme dessinateur de Chrono Trigger original. En parlant dans l'exposition nommée "Hironobu Sakaguchi Reflection : Past, Present, Future of RPGs", il a expliqué que le jeu aurait pu avoir une suite en plus de Chrono Cross, dans lequel le développeur ne fut pas impliqué.

"Nous voulions que la série continue", a dit Sakaguchi." [...] mais nous n'avions pas la même vision que les producteurs, telle que je me suis battu pour cela, et officiellement j'ai perdu la bataille".

Par rapport à ses projets avec Mistwalker, comme Blue Dragon, Lost Odyssey ou The Last Story, il n'y a pas de plans officiels pour des suites. Pour le moment, Sakaguchi travaille dans un nouveau projet appelé Terra Battle, il dispose de la participation de Nobuo Uematsu, Yoshitaka Amano et Kimihiko Fujisaka, dessinateur de la série Drakengard.